Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms