Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
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CCDC142Q17RM4 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
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CCDC142Q17RM4 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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CCDC142Q17RM4 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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CCDC142Q17RM4 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
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