Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms