Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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