Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFIXQ14938 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms