Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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SSPNQ14714 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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