| RUNX2 | Q13950 | LINC02170-201 | ENST00000561519 | 555 nt | TSL 4 BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP005262.1-201 | ENST00000582646 | 997 nt | BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4660-201 | ENST00000583549 | 74 nt | BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Z99289.3-201 | ENST00000605586 | 594 nt | BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009237.15-201 | ENST00000610252 | 501 nt | BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IL21-202 | ENST00000611104 | 707 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC123768.3-201 | ENST00000613733 | 523 nt | TSL 3 BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC023509.5-201 | ENST00000617434 | 807 nt | BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PCDHB2-203 | ENST00000624874 | 565 nt | TSL 5 BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC097655.1-201 | ENST00000635075 | 318 nt | BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR6C71P-202 | ENST00000641886 | 1107 nt | BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IL1RL1-201 | ENST00000233954 | 2058 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01619-203 | ENST00000549802 | 2169 nt | TSL 2 BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KLHL13-203 | ENST00000371878 | 3234 nt | TSL 2 BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BMPR2-201 | ENST00000374574 | 9683 nt | TSL 2 BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PLEKHS1-204 | ENST00000369310 | 2046 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ELF1-204 | ENST00000625359 | 2032 nt | TSL 2 BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ERC2-201 | ENST00000288221 | 6138 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IL1RAPL1-202 | ENST00000378993 | 3667 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL158835.1-203 | ENST00000415305 | 3149 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RLIM-201 | ENST00000332687 | 8317 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ADGRF2-202 | ENST00000398742 | 4895 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CFAP70-201 | ENST00000310715 | 3703 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SUCLA2P2-201 | ENST00000417269 | 1309 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UQCRC2P1-201 | ENST00000417777 | 1332 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CLDND1-208 | ENST00000503004 | 2818 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LCMT1-AS2-202 | ENST00000565214 | 5666 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CTAGE5-208 | ENST00000553352 | 3441 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC099786.3-201 | ENST00000565735 | 1410 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAPK10-328 | ENST00000641553 | 4009 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MLH3-210 | ENST00000556257 | 4229 nt | TSL 5 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR5AU1-203 | ENST00000641697 | 7755 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PLCXD3-201 | ENST00000328457 | 7538 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR513B-201 | ENST00000385136 | 84 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NCSTNP1-201 | ENST00000406229 | 144 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073071.1-201 | ENST00000412410 | 388 nt | TSL 3 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SETP15-201 | ENST00000412724 | 337 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | VPS26BP1-201 | ENST00000417155 | 755 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR2X1P-201 | ENST00000421144 | 687 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL390774.2-201 | ENST00000423942 | 788 nt | TSL 3 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NPM1P24-201 | ENST00000428039 | 894 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NANOGP2-201 | ENST00000435391 | 727 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PSMD10P3-201 | ENST00000437000 | 448 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS29P9-201 | ENST00000440360 | 171 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000146.1-202 | ENST00000441666 | 441 nt | TSL 3 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR7E125P-201 | ENST00000443450 | 846 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC114877.1-201 | ENST00000446601 | 582 nt | TSL 4 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL691482.1-201 | ENST00000453255 | 87 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS6P2-201 | ENST00000454208 | 705 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | XACT-201 | ENST00000468762 | 497 nt | TSL 5 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004453.1-201 | ENST00000487895 | 408 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC069444.1-201 | ENST00000489428 | 266 nt | TSL 3 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC055758.1-201 | ENST00000494509 | 569 nt | TSL 3 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCYBP35-201 | ENST00000503630 | 1137 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC106894.1-201 | ENST00000511735 | 451 nt | TSL 5 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TBCA-203 | ENST00000517679 | 545 nt | TSL 3 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008562.1-201 | ENST00000521763 | 330 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | COX6B1P6-201 | ENST00000522347 | 255 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010306.1-201 | ENST00000523223 | 1117 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO3P15-201 | ENST00000526563 | 574 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007688.2-201 | ENST00000545158 | 369 nt | TSL 3 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | APPL2-203 | ENST00000546731 | 684 nt | TSL 2 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC026401.1-201 | ENST00000549756 | 530 nt | TSL 3 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC138360.1-201 | ENST00000552332 | 386 nt | TSL 3 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL442163.1-201 | ENST00000557251 | 515 nt | TSL 5 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009562.1-202 | ENST00000558755 | 565 nt | TSL 4 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC044860.2-201 | ENST00000561005 | 179 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079411.1-201 | ENST00000565441 | 795 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090751.1-201 | ENST00000566966 | 267 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC127024.5-201 | ENST00000580085 | 462 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090312.2-201 | ENST00000582687 | 378 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001120.2-201 | ENST00000589395 | 296 nt | TSL 3 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | VN1R88P-201 | ENST00000596787 | 292 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022022.2-201 | ENST00000602989 | 360 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009948.4-201 | ENST00000604692 | 675 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C8orf89-201 | ENST00000613105 | 495 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC044839.1-205 | ENST00000614989 | 542 nt | TSL 5 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC123768.4-201 | ENST00000616244 | 701 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC116563.2-201 | ENST00000624751 | 535 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CDRT1-208 | ENST00000630868 | 794 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | WDR75-207 | ENST00000631047 | 270 nt | TSL 5 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC002384.2-201 | ENST00000636036 | 790 nt | TSL 3 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATE1-AS1-202 | ENST00000636460 | 506 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC046144.1-201 | ENST00000478559 | 1853 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TBC1D23-201 | ENST00000344949 | 3656 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ING3-201 | ENST00000315870 | 3777 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01748-204 | ENST00000635048 | 5678 nt | TSL 5 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TNRC6B-201 | ENST00000301923 | 15958 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | VIP-201 | ENST00000367243 | 1581 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NUP155-202 | ENST00000381843 | 4200 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SLC5A12-202 | ENST00000396005 | 6250 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104260.2-201 | ENST00000623551 | 3497 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC138393.1-206 | ENST00000540997 | 1886 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF678-201 | ENST00000343776 | 8556 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KCNJ16-204 | ENST00000585558 | 4014 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ANXA1-201 | ENST00000257497 | 1509 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NUDCD1-202 | ENST00000427660 | 2098 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00989-201 | ENST00000508174 | 2080 nt | TSL 3 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092162.3-201 | ENST00000624511 | 1624 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZEB1-202 | ENST00000361642 | 5990 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |