Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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