Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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CUL3Q13618 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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CUL3Q13618 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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CUL3Q13618 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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CUL3Q13618 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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