Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
AP3B2Q13367 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.3 ms