Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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SEMA3BQ13214 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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SEMA3BQ13214 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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SEMA3BQ13214 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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SEMA3BQ13214 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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SEMA3BQ13214 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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SEMA3BQ13214 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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