Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTPAP49638 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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