Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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HOXD10P28358 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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