Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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