Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 640.8 ms