Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms