Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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ECM1Q16610 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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ECM1Q16610 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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