Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IRF4Q15306 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IRF4Q15306 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IRF4Q15306 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IRF4Q15306 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms