Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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CHD4Q14839 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CHD4Q14839 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CHD4Q14839 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CHD4Q14839 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CHD4Q14839 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CHD4Q14839 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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