Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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TCIRG1Q13488 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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TCIRG1Q13488 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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