Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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