Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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FOXO1Q12778 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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FOXO1Q12778 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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FOXO1Q12778 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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FOXO1Q12778 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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FOXO1Q12778 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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FOXO1Q12778 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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