Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 ABCC2-202ENST00000370449 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CENPFP49454 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CENPFP49454 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CENPFP49454 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CENPFP49454 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CENPFP49454 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CENPFP49454 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CENPFP49454 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CENPFP49454 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CENPFP49454 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CENPFP49454 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.2 ms