Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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