Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ERVV-1B6SEH8 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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