Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRRTQ9BXP5 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms