Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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ECM1Q16610 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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ECM1Q16610 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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ECM1Q16610 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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ECM1Q16610 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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ECM1Q16610 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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