Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TAOK1-201ENST00000261716 12407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ATP2B4-203ENST00000357681 8968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 HIVEP2-203ENST00000367604 10032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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