Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAM2Q15035 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.8 ms