Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms