Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms