Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms