Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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TOP3AQ13472 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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TOP3AQ13472 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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TOP3AQ13472 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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TOP3AQ13472 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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TOP3AQ13472 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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