Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 TARS2P1-201ENST00000506124 2041 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 RNA5SP378-201ENST00000363646 120 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AL713965.1-201ENST00000421166 230 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC097468.2-201ENST00000429343 553 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 PHB2P1-201ENST00000434943 890 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 CD59-206ENST00000445143 825 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 PAQR9-AS1-202ENST00000493825 576 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 IGHVIII-82-201ENST00000522058 250 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 SLC8A1-AS1-228ENST00000627210 225 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 MS4A10-201ENST00000308287 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 ZNF182-201ENST00000376943 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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MKRN4PQ13434 ZNF484-203ENST00000395505 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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MKRN4PQ13434 ZNF736-202ENST00000423484 7119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 PTPRB-201ENST00000261266 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 PIWIL3-204ENST00000533313 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 FAM107A-202ENST00000394481 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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MKRN4PQ13434 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 PIWIL3-201ENST00000332271 3504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 DGKG-203ENST00000382164 3152 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
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MKRN4PQ13434 NMD3-201ENST00000351193 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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MKRN4PQ13434 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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MKRN4PQ13434 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
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MKRN4PQ13434 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
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MKRN4PQ13434 LINC00837-201ENST00000443246 3991 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 ZNF430-203ENST00000595401 3021 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
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MKRN4PQ13434 SLC7A8-206ENST00000469263 3557 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 ZNF674-207ENST00000523374 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC106869.1-203ENST00000419035 1892 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 ABCA4-207ENST00000536513 3740 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
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