Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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ITGB3BPQ13352 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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