Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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