Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 PRICKLE2-AS2-201ENST00000484703 496 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 KCNMA1-AS1-204ENST00000595702 504 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL031594.1-201ENST00000417123 1932 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 DGKB-206ENST00000407950 3651 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 HKR1-201ENST00000324411 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms