Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms