Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC010542.3-202ENST00000561728 701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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