Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms