Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms