Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HTR4Q13639 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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