Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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TCIRG1Q13488 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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TCIRG1Q13488 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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TCIRG1Q13488 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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TCIRG1Q13488 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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TCIRG1Q13488 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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TCIRG1Q13488 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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TCIRG1Q13488 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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TCIRG1Q13488 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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