Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SP140Q13342 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SP140Q13342 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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