Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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SGCGQ13326 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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SGCGQ13326 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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SGCGQ13326 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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SGCGQ13326 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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SGCGQ13326 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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SGCGQ13326 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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