Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
DUSP4Q13115 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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