Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms