Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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