Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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