Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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